You are 4274824 visitor.
Currently 9 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
3UZL NA1469 A, B, C, D, 11RIBOSOME/ANTIBIOTICX-Ray Difraction3.32011-12-07

model 1
>strand_A
uGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGGGGUUUUACUCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUCGGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAUCAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUGAGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCUUGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUACCGGGGUAAUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGGGCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCCGCGAGGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCCAGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGGCGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUC
....[.[[..(.(((..]].].((((.(((((..(((((((.(....(((.(((..(((..((.(.((((.............)))).).)))))......(.(......((((((((..((...(((((.(..((((....((((((....)))))).....)))).....((.(.(((........))).).))...(.((...)).).).)))))..))))))))))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))).).(((((............))))).((((....))))...)))))).).....(.((....(((((....)))).).)))..).))))))..(((.......((((....))))......)))....(((((...(.....(((.....)))......)....)))))......((((([[[...(((((.....((.]]])).......))))))))))..)))))))))..........((([[...(.((((...(((.(((((((..(((.(((((.......((..(.....)..)).....))))).))..).)))))))..(((((((((...(((((.(....(((((((....((........)).......)))))))...........((....)).).)))))..))))).)))..))))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))......{...((((((..(((.(((((.....))))).)))...((..]])).....)))))))))).(((......((((....))))....)))...))).)(((((.(((((((.((..(((.(..((((((((((......((........))...........((((.(..(...(((((.((..(((((((....))))))).(..((......))..))).)))))).((.(((...((((((.(....(((((((.(....).)..((((......))))..)))))).....((((.(((.(.(.......(((.....)))......).).)))...(.(((((....))))).)......)))).....).).)))...)).)))))....).))))....)).)))))))).(...(((((((.....(((..((..((((....))))..))....))).....)))))))......(....(((((((........)))))))....)..)..).))).....(((((((..........)))))))......))...)))))))))).))..(.(..((.(.((((..((..(((((((((((((...(.((((....(((....))).)))).)..)))))))))))))..))..))))..).))...)..)..(((((((((....)))))))))}----
>strand_B
GGUGGGGUUCCCGAGCGGCCAAAGGGAGCAGACUGUAaAUCUGCCGUCAUCGACUUCGAAGGUUCGAAUCCUUCCCCCACCACCA
((.((.(..(...............).(((((..[[[..))))).((.....))...(..((.......))..)).)).))....
>strand_C
CGCGGGGUGGAGCAGCCCGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCGUCGGUUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA
.((((((..((((.........)))).(((((..[[[..))))).....(((((.......))))))))))).....
>strand_D
GGUGGGGUUCCCGAGCGGCCAAAGGGAGCAGACUGUAaAUCUGCCGUCAUCGACUUCGAAGGUUCGAAUCCUUCCCCCACCACCA
(((...(...((.....[.....))..((((.........)))).(((...)))...(.(....]......).))...)))....
>strand_1
GUAAAAAUGUGCAAAA
......]]]]]]....