You are 4274060 visitor.
Currently 9 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
3UZ1 NA1439 A, B1RIBOSOME/ANTIBIOTICX-Ray Difraction3.32011-12-07


model 1
>strand_A
gGUCAAGAUGGUAAGGGCCCACGGUGGAUGCCUCGGCACCCGAGCCGAUGAAGGACGUGGCUACCUGCGAUAAGCCAGGGGGAGCCGGUAGCGGGCGUGGAUCCCUGGAUGUCCGAAUGGGGGAACCCGGCCGGCGGGAACGCCGGUCACCGCGCUUUUUGCGCGGGGGGAACCUGGGGAACUGAAACAUCUCAGUACCCAGAGGAGAGGAAAGAGAAAUCGACUCCCUGAGUAGCGGCGAGCGAAAGGGGACCAGCCUAAACCGUCCGGCUUGUCCGGGCGGGGUCGUGGGGCCCUCGGACACCGAAUCCCCAGCCUAGCCGAAGCUGUUGGGAAGCAGCGCCAGAGAGGGUGAAAGCCCCGUAGGCGAAAGGUGGGGGGAUAGGUGAGGGUACCCGAGUACCCCGUGGUUCGUGGAGCCAUGGGGGAAUCUGGGCGGACCACCGCCUAAGGCUAAGUACUCCGGGUGACCGAUAGCGCACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCGGGAGGGGAGUGAAAUAGAGCCUGAAACCGUGGGCUUACAAGCAGUCACGGCCCCGCAAGGGGUUGUGGCGUGCCUAUUGAAGCAUGAGCCGGCGACUCACGGUCGUGGGCGAGCUUAAGCCGUUGAGGCGGAGGCGUAGGGAAACCGAGUCCGAACAGGGCGCAAACGGCCCGCACGCGGGCCGAAAAGUCCGCGGCCGUGGACCCGAAACCGGGCGAGCUAGCCCUGGCCAGGGUGAAGCUGGGGUGAGACCCAGUGGAGGCCCGAACCGGUGGGGGAUGCAAACCCCUCGGAUGAGCUGGGGCUAGGAGUGAAAAGCUAACCGAGCCCGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUGACUUUAGGGUCAGCCUCAGGCGCUGACUGGGGCCUGUAGAGCACUGAUAGGGCUAGGGGGCCCACCAGCCUACCAAACCCUGUCAAACUCCGAAGGGUCCCAGGUGGAGCCUGGGAGUGAGGGCGCGAGCGAUAACGUCCGCGUCCGAGCGCGGGAACAACCGAGACCGCCAGCUAAGGCCCCCAAGUCUGGGCUAAGUGGUAAAGGAUGUGGCGCCGCGAAGACAGCCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGGCGCCGCGCCGAAAAUGAUCGGGGCUUAAGCCCAGCGCCGAAGCUGCGGGUCUGGGGGAUGACCCCAGGCGGUAGGGGAGCGUUCCCGAUGCCGAUGAAGGCCGACCCGCGAGGGCGGCUGGAGGUAAGGGAAGUGCGAAUGCCGGCAUGAGUAACGAUAAAGAGGGUGAGAAUCCCUCUCGCCGUAAGCCCAAGGGUUCCUACGCAAUGGUCGUCAGCGUAGGGUUAGGCGGGACCUAAGGUGAAGCCGAAAGGCGUAGCCGAAGGGCAGCCGGUUAAUAUUCCGGCCCUUCCCGCAGGUGCGAUGGGGGGACGCUCUAGGCUAGGGGGACCGGAGCCAUGGACGAGCCCGGCCAGAAGCGCAGGGUGGGAGGUAGGCAAAUCCGCCUCCCAACAAGCUCUGCGUGGUGGGGAAGCCCGUACGGGUGACAACCCCCCGAAGCCAGGGAGCCAAGAAAAGCCUCUAAGCACAACCUGCGGGAACCCGUACCGCAAACCGACACAGGUGGGCGGGUGCAAGAGCACUCAGGCGCGCGGGAGAACCCUCGCCAAGGAACUCUGCAAGUUGGCCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCCCUGGGGUGAUGAGCCCCGGGGAGCCGCAGUGAACAGGCUCUGGCGACUGUUUACCAAAAACACAGCUCUCUGCGAACUCGUAAGAGGAGGUAUAGGGAGCGACGCUUGCCCGGUGCCGGAAGGUCAAGGGGAGGGGUGCAAGCCCCGAACCGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAAAGCGUAACGACCGGAGCGCUGUCUCGGCGAGGGACCCGGUGAAAUUGAACUGGCCGUGAAGAUGCGGCCUACCCGUGGCAGGACGAAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGCAGCCUGGUGUUGGCUCUUGGUCGCGCCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUGGCGCGGCUGGGGGCCUAACCCUCGGAUGGGGGGACAGCGCUUGGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUCCCCUCAGGCGGGACGGAAAUCCGCCGGAGAGCGCAAGGGUAGAAGGGGGCCUGACUGCGAGGCCUGCAAGCCGAGCAGGGGCGAAAGCCGGGCCUAGUGAACCGGUGGUCCCGUGUGGAAGGGCCAUCGAUCAACGGAUAAAAGUUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCGAGCGUCCACAGCGGCGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGAAGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGCACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCUCUAUCCGCCACGGGCGCAGGAGGCUUGAGGGGGGCUCUUCCUAGUACGAGAGGACCGGAAGGGACGCACCUCUGGUUUCCCAGCUGUCCCUCCAGGGGCAUAAGCUGGGUAGCCAUGUGCGGAAGGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCCGCCCCAAGAUGAGGCCUCCCACGGCGUCAAGCCGGUAAGGACCCGGGAAGACCACCCGGUGGAUGGGCCGGGGGUGUAAGCGCCGCGAGGCGUUGAGCCGACCGGUCCCAAUCGUCCGAGGUCUUGACC
((((((((......((((((((((.....(((..((((((((((((......((((((.[[..[[[)))...].((((((...(((]]..]].)))......))))))...)))....(((....)))((((((((....)))))))).((((((.....)))))).))...((((((.....(...[..)......))))).).........((....))...(((((.....((.]...))....)))))...((((...((((((((.....))))))))....[.((((((.((......(...(((((.((((.(((...(((((......)))))[[(...).(((.....]])))...)))...))))..)))))..)..)).))).))))....(((((((((.{.....)))))))))....].(((((}.[[[[)))))..)))......)).)))))).))...............((....))....))......(..((((....))))............)).....)))))))))).....(.(((((((((((....))))))))))).[.(.(........).).((((((....(((((((((((((..(((...(((.....)))...)))...((....))..((((.....)))).....((.((........)).))....)))))))))))))..((.(...((((((.....((((((((((.((((...((((((......))))))...).)))...(((..((((.......<)))).)))..).))))))))).(.(((.....)))...)..))))))......).))..((((((....(((((....)))))(((((((((.(...(((((((((...(((...(((.((((...((..(........)...))...)))).)))..)).)...)))))))))..)..))))))).))..(((((((.((......)).))))))).....(((......)))...((((.(((...((([[[...(.((((((.....(.....((..((((((((((.......(((((..((...((.........))...))......(...((......)).).)))))...)))))))))).))..........]]].)....))))))))))...)))))))((((((((.....))))))))....))))))(.(((((...(((......(((((.(((....))))))))...)))..)))))..).....))))))(......((.....((((((.......))))))((((....((((..((..(((((((...((.....)).))))))....[[((((.((...(((...(((....)))...)))...))...(((((........)))))]](((((((((((((...((((....(((((.(((..(((((.((((.(((..{{..).))))))(((...((((((((.((((.((.(.......))).))))......))))))))..)))(...((((....)))).....))))))...)))..)))))(..).....))))...))...))))))))))))))).))).....((......)).)))).(((((....)))))..))))..((((....((((((((.((..(............(((((....(.[..).....)))))((((((((((((.....))))))))))))(...).......(((((((((...((.........))...(((((((.....(((....))).......))))))).]((((.(((..(((((((..(((...((...(((((....)))))...))...))))))))..)))))(((((.........)))))........((..........(((((.......)))))..)..)....))))...)).)))))))....))).)))))))).)))))).....)).{..(((((.....]}.)))))..((((((((.(((..(......((((.((((((..(((((.(((.(((((.((((((((((((((((.(.........(((((..(((......(((((((......)))))))...)))............)))))).))))))))))))))))...(((((....)))))....))))).)))..)))))..(((......[)))((((((..........]))))))([((...(((((((.(.((.(...........).))...).((][.[[[))....)))))))...((((..(((...{..)))..)))).(((....))).))]]].].....(((((((.((..]]]]..))))))))).....)}......))))..))))))......(((((.(.((((((...((.......))...))))))...)))).).)......((((.((((((..(((((((((......))))))..))).(((((.....))))).....)))))..)...))).).....(((((((....))).))))..>.)...)))))))))))[...(((((((...(((...(((((((.....(....)....))))))).(((((...((((...(((((((((((.}}.))))))...)))))...)))).)))))...(((....((((.............))))....)))..)))..]....)))))))(.((((.....))))....(((((((((.......)))))....((((((((..((....(((.(....).)))...))...))))).)))...))))...)))))))))
>strand_B
aAUCCCCCGUGCCCAUAGCGGCGUGGAACCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGAAGUGAAACGCGCCAGCGCCGAUGGUACUGGGCGGGCGACCGCCUGGGAGAGUAGGUCGGUGCGGGGGA
..(((((((((((....((((((((....(.(.(((...(.....)...)))...).)...)))))).))(((.......((.(((((....))))).)).......))).)))))))))))