You are 4274057 visitor.
Currently 9 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
3J2L 1, 31RIBOSOMEElectron Microscopy6.62012-10-25

model 1
>strand_1
gGGCUAGGACGCUAAGCCGCCCGGUGGAUGGCUCGGCUCGGGGCGCCGACGAAGGGCGUGGCAAGCUGCGAUAAGCCCCGGCGAGGCGCAGGCAGCCGUCGAACCGGGGAUUCCCGAAUGGGACCUCCCGCGGCUUAUGCCGCACUCCGGGGUUUAUCCCCGGAGGGGGAACGCGGGGAAUUGAAACAUCUUAGUACCCGCAGGAAAAGAAAGCAAAAGCGAUGCCGUGAGUAGGGGCGACCGAAAACGGCAGAGGGCAAACUGAACCCCGGGCCGACGAGGUUCGGGGGAUGUGGGGUUGUAGGGCCCCCGUAUGAGACCCUCGCGGGUGAAGCCGAAGUCCGCUGGAACGCGGCGCCGGAGAGGGUGAUAGCCCCGUAGGCGUAAGCCCGCAGGGUCUCGGGGGACCCUGAGUACCGUCGGUUGGAUAUCCGGCGGGAAGCUGGGAGGCAUCGGCUCCCAACCCUAAAUACGUCCCGAGACCGAUAGCGAACUAGUACCGUGAGGGAAAGCUGAAAAGCACCCCGGGAGGGGGGUGAAAAGAGCCUGAAACCGGGCGGCGAUAGGAGGGUGCGGCCCGAAAGGAAUGAGCCUCCCCGAAGGAAACCGCGGCGACGCGGGAGUACGAGGGGAGGGGACCGGGGUUGCACCGUCCGUCUUGAAACACGGGGCAGGGAGUUCGCGGCCGUGGCGAGGUUAAGGGGGUUAAGCCCCGUAGCCGCAGGGAAACCGACAUGCCCGCAGCCGGGCUUAUGCCCGGUGAGGGGCGGGGUGCGAAAGCGCCCGGAGUCACGGCCGCGAGACCCGAAACCGGUCGAUCUAGCCCGGGGCAGGGUGAAGUCCCUCAACCGAGGGAUGGAGGCCCGCUAGGGGUGCUGAUGUGCAGUUCGCUCCCGUGACCCCGGGCUAGGGGUGAAAGGCCAAUCGAGGCCGGAGAUAGCUGGUUCCCGCCGAAUCAUCCCGCAGGAUGGCCUCCCCGGAGGUAGGCGGUGGGGUAGAGCACUGAUUGGAGGUGCAGGGGGCGAAAGCCCCCGGCCUCCUGUCAAACUCCGAACCCACCGCCGCCGUAGAUGGGGGGAGUAGGGUGGCGGUGUAAGCCGUCCACCGAGAGGGGAACAACCCAGACCGGGGUUAAGGCCCCAAAGUGCCGGCUAAGUGUUACUCCAAAGGGUGUCCCGGGCCUUAGACAGCGGGGAGGUAGGCUUAGAAGCAGCCAUCCUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACCCGUCGAGGUCCGGGGCCCCGAAAAUGGACGGGGCUCAAGCCGGCCGCCGAGACCCCGGCGCACGGACCGAUUGGUCCGUGAUCGGGUAGGCGGGCGUGCCGGUGGCGUAGAAGCCGGGCCGUAAGGUCCGGUGGAGCCGCCGGUAUCGCGGAUCCUGCCGGGAGUAGCAGCGUAGUCGGGUGAGAAUCCCGACCGCCGGAGGGGCCAGGGUUCCACGGCAAUGGUCGUCAGCCGUGGGUUAGUCGGUCCUAACCCCGCCCGUAACUCGGCGCGGGGGAAAGGGAAACGGGUUUAUAUUCCCGUACCGCGGGGGUAGGUGCGGCAACGCAAGCCCGGAGGGUGACGCCUCGGGGUAGGCGGACCGGCCGAUGAGGCCGGCUAAGCGUAUAAGCCCGGGGAGUGCCGUAAUGGCGAGAACCGGGUGAAAGCGCGAAUGGCCCCCCCGUUAGGGGGGUUCCGCCGAUCCCUGGGGCCCGUGAAAAGCCCUCCGGGAAUUCCGAUCCCCCGCGACCGUACCGAGAACCGACACAGGUGCCCCUGGGUGAGAAGCCUAAGGCGUGUCGGGGGAAACCCGGCCGAGGGAACUCGGCAAACUGGCCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCCUGCGGGUGCGUAACCCGCAGGUCGCAGUGACUAGGGGGGCCCGACUGUUUAAUAAAAACACAGGUCCCAGCUAGCCCGAAAGGGUUUGUACUGGGGCCGACGCCUGCCCAGUGCCGGUAUGUGAAGCCCGGGUACAACCGGGUGAAGCACCGGUAAACGGCGGGGGUAACUAUAACCCUCUUAAGGUAGCGAAAUCCUUGUCGGUUAAAUGCCGACCUGCAUGAAUGGCGUAACGAGGUCCCCGCUGUCCCCGGCCGGGGCCCGGCGAAACCUCUGCCUGGCGCGCAUGCCAGGGACCCCCGGUGGGAAGCGAAGACCCCAUGGAGCUUUACUGCAGCCUGCCGUUGCCACACGGCGGGGGGUGCGCAGCGUAGGCGGGAGGCGUCGAAGCCCGGCCUCCGGGUCGGGUGGAGCCGUCCAUGAGACACCGCCCACUCCCCGCUGUGUGGCUAACCCCCGAAAGGGGGGACAGCGGUAGGUGGGCAGUUUGGCUGGGGCGGCACGCCUCCGAAAAGGUAUCGGAGGCGCCCUAAGGUCGGCUCAGGCGGGUCAGGAAUCCGCCGUAGAGUGCAAGGGCAAAAGCCGGCCUGACUGGACCCGUAACAGAGGCGGGUCCAGCCCCGAAAGGGUGGCCUAGCGAACCCCUGUGCCUCCCCGGUGGGGGCCAGGGAUGACAGAAAAGCUACCCUGGGGAUAACAGAGUCGUCUCGGGCGAGAGCCCAUAUCGACCCCGAGGCUUGCUACCUCGCUGUCGGCUCUUCCCAUCCUGGCCCUGCAGCAGGGGCCAAGGGUGGGGGUGUUCACCCAUUAAAGGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUCGGAUGCUAUCUACCGGGGGUGUUGGCCGCCUGAGGGGAAGGUGCCCCUAGUACGAGAGGAACAGGGUGCCGCGGCCUCUGGUCUACCGGUUGUCCUCCCGGGCAUCGCCGGGCAGCUACGCCGCAGCCGAUAAGGCCUGAAAGCAUCUAAGGCCGAAGCGGCCCCCGAAAAUAGGCGGCCGUUCCCUGGCGCUUGGGCCUGGGCGACCGGCCCAUUGCCAGGGACGAGGGCUCGGGUAGAAGACCCGGUUGAUAGGGCGGGGAUGUAAGCGGGAAGGGUCAACCGACCCGCUUAGUCCGCCGCCCCUAAUCGCCCGAGGUCCUGCCCC
(((.((((.......(((((((((.....(((..(((((((((...(......((((((.[[..[[.)))....(((((((...(((]]..]].)))......)))))).).)))....(((...))).((((......))))..((((((.......))))))..)....((((((.....(...[..)......))))).).........((....))....(((......((.]...)).....)))....((((...((..((((((((((.....)))))))))....)))..........(((.(.......(((((.((((((...((....(.((((......)))))[[......(((.....]])))....))....)))))))))))...))))......)....(((((((........)))))))......(((((.[[[[[[)))))..)))........))))))).))...............((....))....))......(..(((.......)))..........)).....)))))))))........((((((((((....((......(((((((...(....(((((....))))).....)..)))))))...)).))))))))))...(((........))).((((((....(((((((((((((..(((....((.........))...)))...((....)).....((((...((((((......))))))...))))..((((......))))....)))))))))))))..((.(...(((((......((((((.((..((((...(((((((....)))))))...).)))....(((..((.((........)))).)))....)).)))))).(.(((.....)))...)...)))))......).))..((((((....((((......))))..(((((((...((.((((((.((...(((...........((.(...(.((.......)).)..))).........)).)...)).))))))))......)))))))....((..((((((....))))))..))....(((......)))...(((((((...((([[[...(.((((((.....((.........((..((((((.(............(..(((..(((.........)))..))).........(.........)...)........).)))))).))..........]]]))....))))))))))...)))))))((((((((((....))))))))..))....))))))(.((((((((((......((((((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((......(......((((((.......))))))(.((....(((...((..(((((((...((.....)).)))))).....[(((.((...((((((.((.....))..))))))....))...(((((........)))))].((((((((....(.(......)....(...((((((...((((((.((.....((.((.(((.....))).))....((((.....(((((.....(((.....))).....))))).....)))).....(.((((((....)))))).).).)....)).))))))(...)....))))))...))........)))))))).))).)))......(......)...)))..(((.......)))..)).)...((((.....((((((((.(...(....(.......(((((....(.[..).....)))))(((((((((((..).))))))))))(...).......(((((((((...((.........))....((((((.....(((....))).......))))))..].(((.(((..(((((((..(((...((((((......))))))...))))))))..)))))((.((.........)).))........((.........(((((.......)))))..)..)....)))....)).))))))).)..).).)))))))).))))).....))....(((((........)))))..(((((((..(((.((......((((.((((((..(((((.(((((((((.((((((.(((((.(...(.........(((.(..(.(......(.(..(.((...)))..).)...).)............).))))...).))))).))))))...(((((....)))))....)))))))))..)))))..(((......[)).)((..((..........]))..))([((....((((((.(.((((((.......))))))...).((][.[[[))....))))))....((((((((...........)))))))).(((....))).))]]].].....(((((.(((((.]]]]]]))))))))))....).....))))..)))))).......(.((.(.((((((...((.......))...))))))...)))..).......(((((.((((((..(((((((((......))))))..)))..(((.......)))......)))))..)...))).))....(((((((....))).))))....))..))).)))))))....(((((((...((((..(((((((......(....).....)))))))(((((...((((...((((((((((....)))))..))))).[.)))).)))))..(((.(..((((.............))))...)))).)))).......)))))))(..((.(((((..((((((.((....)))))))).))))))).....(((.(((((.......)))))....(((.((((((((.....((((..((.....))..))))....))))]))))..)))....)))....))))).)))
>strand_3
CGGCGGCCAUAGCGGGGGGGCCACACCCGGUCUCAUUUCGAACCCGGAAGUUAAGCCCCCCAGCGAUCCCGGUUGUACUGCCCUCCGAGAGGGGGCGGGAAGCCGGGGACGCCGCCGGCCACUAUC
.((((((....(((.((((.....(.((((...(.....)...))))...)....)))).).))..(((((((....((((((.((....))))))))...)))))))..))))))..........