You are 4274064 visitor.
Currently 9 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
2XUY 2XUY A, V, X1RIBOSOMEElectron Microscopy7.62010-10-21

model 1
>strand_A
UUUGUuGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGGGGUUUUACUCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUCGGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAUCAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUGAGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCUUGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUACCGGGGUAAUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGGGCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCCGCGAGGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCCAGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGGCGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU
-----....((((..[.[[[..)))).((((.(((((..(((((((((....(((.((...(((..((.((...(.............)...)).)))))......(((......((((((((..((...(((((((.(((((....((((((....)))))).....)))))....((((.(((((....))))).))))...((((...)))).)))))))..))))))))))(((....(((...(((((((.......))))))).)))......)))..((((((((....))))...))))))).(..((............))..).(((......)))....))))).).....(.(((...(((((....)))).))))).)).))))))..((((......((((....)))).....))))......(((...(....(((.......))).....)....)))........((((([[[.....(((.....((.]]])).......)))..)))))..)))))))))..........((([[...(.((((...(((.(((((((.((((((((.(......((((((.....))))))....).))))))..)))))))))..(((((((((...((((((((...(((((((....((........)).......)))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....((((((...((...((.(.........).))...))))))))......{...((((((..(((((((((.....)))))))))...((..]])).....)))))))))).(((......((((....))))....)))...]]].](((((.((.((((.((..(((((..(((((((.((......((........))..........((..(((..(...(..............((....)).............................)).((.(.....((((((.(....(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((.((((.((...((.............))....)).)))).....(((((....)))))........)))).....).).)))...))...)))....)))..))...))..))))))).(...(((((((.....(((......((((....))))........))).....)))))))......(....(((((((........)))))))....)..)..))))).....(((((((..........)))))))......))...)))).))))).))..(.(..((.(.((((.(((..(((((((((((((...(.((((....((.(...))).)))).)..)))))))))))))..))).))))..).))...)..)....(.(((((....))))).)..}..-------------
>strand_V
cGCGGGGUGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCGUCGGUUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA
..(((((..((((.........)))).(((((..[[[..))))).....(((((.......))))))))))......
>strand_X
uAAAAAUGUUC
.....]]]...