You are 4274061 visitor.
Currently 9 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
2XQD NA0832 A, V, W, X, Y1RIBOSOMEX-Ray Difraction3.12010-09-02

model 1
>strand_A
UUUGUuGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGGGGUUUUACUCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUCGGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAUCAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUGAGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCUUGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUACCGGGGUAAUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGGGCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCCGCGAGGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCCAGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGGCGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU
-----....((((..[.[[[..)))).((((.(((((..(((((((((....(((.((...(((..((..(.....................)..)))))......(((......((((((((..((...(((((((.(...(......(...(...)..).......)...)....((.(.(((((....))))).).))...((((...)))).)))))))..))))))))))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).((.((............)).)).(((......)))....))))).).....(.((....(((((....)))).).))).)).))))))..((((......((((....)))).....))))....(((((...(.....(((.....)))......)....)))))......((((([[[...(((((.....((.]]])).......))))))))))..)))))))))..........((([[...(.((((...(((.(((((((.((((((((((......((((((.....))))))....))))))))..)))))))))..(((((((((...((((((((...(((((((....((........)).......)))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))......{...((((((..(((((((((.....)))))))))...((..]])).....)))))))))).(((......((((....))))....)))...]]].](((((.(((((((.((..(((((..((((((((((......((........))..........(((((((..(...............(((........)))...........................).((.(((...((((((.(....(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((.((((((....(..............)......)))))).....(((((....)))))........)))).....).).)))...)).)))))....)))))))...)).)))))))).(...(((((((.....(((..((..((((....))))..))....))).....)))))))......(....((((.((........)).))))....)..)..))))).....(((((((..........)))))))......))...)))))))))).))..(.(..((.(.((((.(((..(((((((((((((...(.((((....(((....))).)))).)..)))))))))))))..))).))))..).))...)..)..(((((((((....)))))))))}..-------------
>strand_V
gCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA
(((((((..((((........)))).(((((..[[[..))))).....((.((.......)).)))))))))....
>strand_W
gCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA
(((((.....((..........))..(.((.........)).).....(...(.......)...)..)))))....
>strand_X
aAAUGUUCUGGAAA
.....]]][[[...
>strand_Y
AGGGGCGuAGUUCAAuuGGuAGAACACCGGUcUCCAaAACCGGGUgUUGGGAGuuCGAGUCUCUCCGCCCCUGCCA
((.((((..((((........))))((((((..]]]..))))).)...(((((.......))))))))).))....