You are 4274063 visitor.
Currently 9 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
2WRI NA0236 A, V, W, X1RIBOSOMEX-Ray Difraction3.62009-09-01

model 1
>strand_A
UUUGUuGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGGGGUUUUACUCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUCGGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAUCAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUGAGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCUUGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUACCGGGGUAAUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGGGCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCCGCGAGGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCCAGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGGCGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU
-----....((((..[.[[[..)))).((((.(((((..(((((((((....(((.(((..(((..((.((...(.............)...)).)))))......(((......((((((((..((...(((((((.(((((....((((((....)))))).....)))))....((((.(((((....))))).))))...((((...)))).)))))))..))))))))))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(.(((............))).).(((......)))...)))))).).....(.(((...((((......))).))))).)).))))))..((((......(((......))).....))))......(((...(....(((.......))).....)....)))........((((([[[.....(((.....((.]]])).......)))..)))))..)))))))))..........((([[...(.((((...(((.(((((((..(((((((.(......((((((.....))))))....).))))))..).)))))))..(((((((((...((((((((...(((((((....((........)).......)))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))......{...((((((..((((((((((...))))))))))...((..]])).....)))))))))).(((......((((....))))....)))...]]].](((((.(((((((.((..(((((..(((((((.((......((........))..........((..(((..(...(..............((....)).............................)).((.(((...((((((.(....(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((.(((((((...((.............))....))))))).....(((((....)))))........)))).....).).)))...)).)))))....)))..))...))..))))))).(...(((((((.....(((......((((....))))........))).....)))))))......(....(..((((........))))..)....)..)..))))).....(((((((..........)))))))......))...)))))))))).))..(.(..((.(.((((.(((..(((((((((((((...(.((((....((.(...))).)))).)..)))))))))))))..))).))))..).))...)..)....(.(((((....))))).)..}..-------------
>strand_V
cGCGGGGUGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCGUCGGuUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA
..(((((..((((.........)))).(((((..[[[..))))).....(((((.......))))))))))......
>strand_W
cGCGGGGUGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCGUCGGuUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA
..(.(.(....((.........))...(((.(.......).))).....(((((.......)))))).).)......
>strand_X
GGCAAGGAGGuAAAAAUGUUCAAAA
----------.....]]]...----