You are 4274063 visitor.
Currently 9 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
1VQ9 RR0105 0, 9, 41RIBOSOMEX-Ray Difraction2.42004-12-16

model 1
>strand_0
UUGGCUACuAUGCCAGCUGGUGGAUUGCUCGGCUCAGGCGCUGAUGAAGGACGUGCCAAGCUGCGAUAAGCCAUGGGGAGCCGCACGGAGGCGAAGAACCAUGGAUUUCCGAAUGAGAAUCUCUCUaACAAUUGCUUCGCGCAAUGAGGAACCCCGAGAACUGAAACAUCUCAGUAUCGGGAGGAACAGAAAACGCAAUGUGAUGUCGUUAGUAACCGCGAGUGAACGCGAUACAGCCCAAACCGAAGCCCUCACGGGCAAUGUGGUGUCAGGGCUACCUCUCAUCAGCCGACCGUCUCGACGAAGUCUCUUGGAACAGAGCGUGAUACAGGGUGACAACCCCGUACUCGAGACCAGUACGACGUGCGGUAGUGCCAGAGUAGCGGGGGUUGGAUAUCCCUCGCGAAUAACGCAGGCAUCGACUGCGAAGGCUAAACACAACCUGAGACCGAUAGUGAACAAGUAGUGUGAACGAACGCUGCAAAGUACCCUCAGAAGGGAGGCGAAAUAGAGCAUGAAAUCAGUUGGCGAUCGAGCGACAGGGCAUACAAGGUCCCUCGACGAAUGACCGACGCGCGAGCGUCCAGUAAGACUCACGGGAAGCCGAUGUUCUGUCGUACGUUUUGaAAAACGAGCCAGGGAGUGUGUCUGCAUGGCAAGUCUAACCGGAGUAUCCGGGGAGGCACAGGGAAACCGACAUGGCCGCAGGGCUUUgCCCGAGGGCCGCCGUCUUCAAGGGCGGGGAGCCAUGUGGACACGACCCGAAUCCGGACGAUCUACGCAUGGACAAGAUGAAGCGUGCCGAAAGGCACGUGGAAGUCUGUUAGAGUUGGUGUCCUACAAUACCCUCUCGUGAUCUAUGUGUAGGGGUGAAAGGCCCAUCGAGUCCGGCAACAGCUGGUUCCAAUCGAAACAUGUCGAAGCAUGACCUCCGCCGAGGUAGUCUGUGAGGUAGAGCGACCGAUUGGUGUGUCCGCCUCCGAGAGGAGUCGGCACAcCUGUCAAACUCCAAACUUACAGACGCCGUUUGACGCGGGGAUUCCGGUGCGCGGGGUAAGCCUGUGUACCAGGAGGGGAACAACCCAGAGAUAGGUUAAGGUCCCCAAGUGUGGAUUAAGUGUAAUCCUCUGAAGGUGGUCUCGAGCCCUAGACAGCCGGGAGGUGAGCUUAGAAGCAGCUACCCUCUAAGAAAAGCGUAACAGCUUACCGGCCGAGGUUUGAGGCGCCCAAAAUGAUCGGGACUCAAAUCCACCACCGAGACCUGUCCGUACCACUCAUACUGGUAAUCGAGUAGAUUGGCGCUCUAAUUGGAUGGAAGUAGGGGUGAAAACUCCUAUGGACCGAUUAGUGACGAAAAUCCUGGCCAUAGUAGCAGCGAUAGUCGGGUGAGAACCCCGACGGCCUAAUGGAUAAGGGUUCCUCAGCACUGCUGAUCAGCUGAGGGUUAGCCGGUCCUAAGUCAUACCGCAACUCGACUAUGACGAAAUGGGAAACGGGUUAAUAUUCCCGUGCCACUAUGCAGUGAAAGUUGACGCCCUGGGGUCGAUCACGCUGGGCAUuCGCCCAGUCGAACCGUCCAACUCCGUGGAAGCCGUAAUGGCAGGAAGCGGACGAACGGCGGCAUAGGGAAACGUGAUUCAACCUGGGGCCCAUGAAAAGACGAGCAUAGUGUCCGUACCGAGAACCGACACAGGUGUCCAUGGCGGCGAAAGCCAAGGCCUGUCGGGAGCAACCAACGUUAGGGAAUUCGGCAAGUUAGUCCCGUACCUUCGGAAGAAGGGAUGCCUGCUCCGGAACGGAGCAGGUCGCAGUGACUCGGAAGCUCGGACUGUCUAGUAACAACAUAGGUGACCGCAAAUCCGCAAGGACUCGUACGGUCACUGAAUCCUGCCCAGUGCAGGUAUCUGAACACCUCGUACAAGAGGACGAAGGACCUGUCAACGGCGGGGGUAACUAUGACCCuCUUAAGGUAGCGUAGUACCUUGCCGCAUCAGUAGCGGCUUGCAUGAAUGGAUUAACCAGAGCUUCACUGUCCCAACGUUGGGCCCGGUGAACUGUACAUUCCAGUGCGGAGUCUGGAGACACCCAGGGGGAAGCGAAGACCCUAUGGAGCUUUACUGCAGGCUGUCGCUGAGACGUGGUCGCCGAUGUGCAGCAUAGGUAGGAGACACUACACAGGUACCCGCGCUAGCGGGCCACCGAGUCAACAGUGAAAUACUACCCGUCGGUGACUGCgACUCUCACUCCGGGAGGAGGACACCGAUAGCCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUACGCGCUCGAAAAGAUAUCGAGCGCGCCCUAUGGCUAUCUCAGCCGGGACAGAgACCCGGCGAAGAGUGCAAGAGCAAAAGAUAGCUUGACAGUGUUCUUCCCAACGAGGAACGCUGACGCGAAAGCGUGGUCUAGCGAACCAAUUAGCCUGCUUGAUGCGGGCAAUUGAUGACAGAAAAGCUACCCUAGGGAUAACAGAGUCGUCACUCGCAAGAGCACAUAUCGACCGAGUGGCUUGCUACCUCGAUGUCGGUUCCCUCCAUCCUGCCCGUGCAGAAGCGGGCAAGGGUGAGGUugUUCGCCUAUUAAAGGAGGUCGUGAGCUGGGuUuAGACCGUCGUGAGACAGGUCGGCUGCUAUCUACUGGGUGUGUAAUgGUGUCUGACAAGAACGACCGUAUAGUACGAGAGGAACUACGGUUGGUGGCCACUGGUGUACCGGUUGUUCGAGAGAGCACGUGCCGGGUAGCCACGCCACACGGGGUAAGAGCUGAACGCAUCUAAGCUCGAAACCCACUUGGAAAAGAGACACCGCCGAGGUCCCGCGUACAAGACGCGGUCGAUAGACUCGGGGUGUGCGCGUCGAGGUAACGAGACGUUAAGCCCACGAGCACUAACAGACCAAAGCCAUCAU
--------...(((((((((.....(((..((((((((.(((......((((((.[[..[[.))).....((((((...(((]]..]].)))......))))))...)))....(((...)))(--.)..(((((.....))))).))...((((((.....(...[..)......))))).).........((.....))...(((((.....((.]...))....)))))...((((...((..(((((....))))....))).....((((((((......(..(.....(((((((....({((((......)))))[[(...).(((....}]])))....)))))))......)..)...)))))).)).)....(((((((........)))))))......(((((.[[[[[[)))))..)))......)..)))))).))...............((....))....))......(...(((.....))).............)).....)))))))))......(.((((((((((....((((((..((....(....(((((....))))).....)...))..))))..)).)))))))))).{.(((........))).((((((....(((((((((((((..(((...((((.....))))...)))...((....))..(..((((...((((..-))))...)))))((((((....))))))...)))))))))))))..((.(...((((((.....((((((((((.((((...(((((((....)))))))...).)))....(((..((.((........)))).)))..).))))))))).(.(((.....)))...)..))))))......).))..((((((....(((((....)))))..((((((....((.(((((((((...(((.....((..((.----------------------------))..))...)).)...)))))))))))........)))))).....((((((((((.....))))))))))....(((......)))...(((((((...((([[[...(.((((((.....((...........(((.((((((((((.......(((((.((...(((.........)))...))........((........))..)))))...)))))))))))))..........]]]))....))))))))))...)))))))(((((((.......)))))..))....))))))(.(.((((((((......((((((((....))))))))...)))))))).)..).....))))))((.....((.......((((((.......))))))((((....((((..((..(((((((...((.....)).))))))....[[(((.((...((((((.((.....))..)))))).....))...(((((........)))))]]((((((((.......(((...((((((((...((((((((((((..-<<.))))))(...(((((....(((((....(((.....))).....))))).....)))))....)(....)))))))...))))))))(...)....)))..)))))))).))).))).....((......)).))))..(((.......)))..))))...((((.....((((((((.((..(....(.......(((((....(.[..).....)))))(((((((((.....)))))))))(...).......(((((((((...((.........))...(((((((.....(((....))).......))))))).].(((.(((..(((((((..(((.....((((......)))).....))))))))..)))))((...------------))........((..........(((((.......)))))..)..)....)))....)).))))))).)..))).)))))))).))))))....)))[[..(((((.....}]])))))..(((((((..(((.((.......(((.((((((..(((((.((((((((..(((----------------------------------------------------------------------------------------------------..)))...((((....)))).....))))))))..)))))..(((..{{..[)).)((((((..........]))))))([((...(((((((.(.((((((-----..))))))...).((][.[[[))....)))))))...(((((((((.........))))))))).(((....))).))]]].].....(((((.(((((.]]]]]]))))))))))....).....))))..))))).......(((((.((((((((...((.......))...)))))))..)))).).).....(((((.((((((..(((((((((......))))))..)))..((((.....))))......)))))..)...))).))....(((((((....))).))))....))..))).)))))))....--((((((...((((..((((((((.....(....)....))))))))(((((...((((...((((((((((>>..)))))...))))).[.)))).)))))..(((....((((.............))))....))).)))).......)))))).....(((((((((.......)))))....(((.((((((((....(((((..(....)..)))))...))))]))))..)))...))))..---------
>strand_9
uUAGGCGGCCACAGCGGUGGGGUUGCCUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCCACCAGCGUUCCGGGGAGUACUGGAGUGCGCGAGCCUCUGGGAAACCCGGUUCGCCGCCACC
...((((((....((((((((......((((((...(.....)...))))..))....)))))).))...(((((.....((((((.((....))))))))....)))))...))))))...
>strand_4
cCA
}}.