You are 4274066 visitor.
Currently 9 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
1PNS RR0072 A, V, U, W1RIBOSOMEX-Ray Difraction8.72003-06-13

model 1
>strand_A
uGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGAUACGCGCGGCCCCUUGGGGCCGUGCGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUCGGGCUAAUCCCCCAUGUGGACGCAAGUCCAAAGGGGGAAGCCUUCGGGUCCCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAUCAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUGAGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCUUGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCAGGGCCACUCAUACUGGCUCUGACUGACGGUACCGGGGUAAUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGGGCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGCGGCUCAACCGCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCUUCGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCCAGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGUAACCUACGGGAAGCAGGCGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCA
....((((.........)))).((((.(((((..(((((((((....(((.(((..(((..((.((..((((((((((....)))))))))))).)))))......(((......((((((((..((...(((((((.(((((....((((((....)))))).....)))))....((((....))))...((((((..((....)))))))).)))))))..))))))))))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((............))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....)))).))))).)).))))))..((((......((((....)))).....))))....(((((...(....((((((((.......)))))))).....)....)))))......((((([[[...(((((.....((.]]])).......))))))))))..)))))))))..........((([[...(.((((...(((.(((((((.((((((((((......((((((.....))))))....))))))))..)))))))))..(((((((((...((((((((...(((((((....((........)).......)))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))......{...((((((..((((((((((((.....))))))))))))...((..]])).....)))))))))).(((......((((....))))....)))........(((((.(((((((.((..(((((..((((((((((......((........))..........((((((...(...((((((......(((((....))))).....((....))....))))))).((.(((...((((((.(....(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.((((((........(((.....))).......)))))).....(((((....)))))........)))).....).).)))...)).))))).....))))))...)).)))))))).(...(((((((.....(((..((..((((....))))..))....))).....)))))))......(....(((((((........)))))))....)..)..))))).....(((((((..........)))))))......))...)))))))))).))..(.(..((.(..(((.(((..(((((((((((((...(.((((...(..((....))..)..)))).)..)))))))))))))..))).)))...).))...)..)..(((((((((....)))))))))}.....
>strand_V
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA
.((((((..((((.....[..)))).(((((...{...))))).....(((((..]....))))))))))).....
>strand_U
AUGUUCAAACGUAAUAAU
.}.......---------
>strand_W
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA
(((((((..((((.....[..)))).(((((.......))))).....(((((..]....))))))))))))....