You are 4279265 visitor.
Currently 9 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
4A1B NA1397 11RIBOSOMEX-Ray Difraction3.522011-09-14


model 1
>strand_1
cUACACCUGAAACAAGCAAGAUUACCCGCUGAACUUAAGCAUAUCAGUAAGCGGAGGAAAAGAAACUAACUAGGAUAGCCCCAGUAAUGGCGAAUGAACAGGCUAAAGCUCAAAGUGAAAAUCUGAAGUGGUCAACACAACAGAAUUGUAAUCUAAAGGGUCAACCUGAAACUAAGCUCCUCUCAUAAGUUCCUUGGAACAGGACGUCAAAGAGGGUGACAACCCCGUAGUCGGAGAGGAAGGCUGGUGUAAGGGAGAUUUCAAAGAGUCGGGUUGUUUGGGAUUGCAGCCCUAAGUGGGAGAUAAACUUCUUCUAAAGCUAAAUAUACACGGGAGACCGAUAGCGAACAAGUACUGCGAAGGAAAGAUGAAAAGAACUUUGAAAAGAGGGCUAAAAGACUUGAAACCGUUGAGAAGGAAGCUGUAGAAGAGCAAUAAACUGGACGGCGCAUAAGGGGGAAGUACUAAUCACUGCAGAGUCGAUACGUAAAAGGUCGAUGAGUAAGGAAAUGGUACAGAACUUGCUACGCCGGUCAGAAGACAAAAUGGGUUCAGAUUGAAGGAGUCACCUGAGAUCGGGCAGCAAUGCAGAUCAAAAGGAAAACUUCAAACUGGACUGAGGGGCCUAAGGGCGAUUUUGUCAAAAUGGCUUCUACUGACCCGUCUUGAAACACGGACCAAGGAGUCUAUCAAUUAAGCGAGUGAUAGGGUGGAAAAACCCGUCCGCGAAACGAAAGUGAGUACAAGGUGCCAAGCCGCAAGGUAGCAGCAUCACCCGACCUUGAGUCUCCGACGAAGGGUUCGAGGAAGAGCUUAAUUGUUAGGACCCGAAAGAUGGUGAACUACGCUUGAAUAGGGUGAAGCCAGGGGAAACUCUGGUGGAAGCUCGUAGCGAUACUGACGUGCAAAUCGUUCGUCAAAUUUGAGUGUAGGGGCGAAAGACUAAUCGAACCAUCUAGUAGCUGGUUCCCUCCGAAGUUUCUCUCAGGAUAGCAAGAGCAAGUACGCAGUUUUAUUAGGUAAAGCGAAUGAUUAGAGGACUCGGGGUUCCAAGAAUCUCGACCUAUUCUCAAACUUUAAAUUGGUAAGAGCCGCGGAGUUUACUUAAAUGAACUCUCGGGAAGAAUGCAGUGCUCUUAGUGGGCCAUUUUUGGUAAGCAGAACUGGCGAUGAGGGAUGAACCUAACGUUGAGAUAAGGCGCCCAAAUGCACGCUCAUCAGAUACCACAAAAGGUGUUGGUUCAUACGGACAGCAGGACGGUGGCUAUGGAAGUUAGAAUCCGCUAAGGAGUGUGUAACAACUCACCUGCCGAAUGAACUAGCCCUGAAAAUGGAUGGCGCUGAAGCGUGUUGCCGAUACUCAACCAUCAGAGCAAAUGCGAGGCUUUGAUGAGUAGGAGGGCGUGAUCGUUGCCUAGAAGUAUUGGGCGUGAGCCUAUAUGGAGCAGCGAUUAGUGCAGAUCUUGGUGGUAGUAGCAAAUAUUCAAAUGAGAACUUUGAAGACCGAAGUGGAGAAGGGUUCCAUGAGAACAGCAAUUGUUCAUGGGUUACUCGAUCCUAAGACAUAGGUUAACUCCUUGCAAUACAAGAAGACAUUCGUUUUCGUUGUCAAAAGGGAAUGAGGUUAAUAUUCCUCAAGCUGGACGUGGUAUAGAGCGGUAACGCAAAGAAACCCGGAGACGUCAGCAGGUGUCACUGGAAGAGUUAUCUUUUCUUUUUAACAUACUAUGGCCAUGAAAUUGGAUUAUCCAGAGAUAUCGGCUGUAUGUAUGGCAGAGCAGCUCACCCUAAGAGCUGUCAGUUGCGCACCUGAUGACCCUUGAAAAUCUGGGGGAGACAUAAUUUCACGCCAGUUCGUACCCAUAACCGCAUCAGGUCUCCAAGGUUAGCAGCCUCUGGUCCAUAGAACAAUGUAGAUAAGGGAAGUCGGCAAAUUGGAUCCGUAACUUCGGGAUAAGGAUUGGCUCUGAGGAUCGGGUAUAAAGGCUUUGUAAUGAUAUCCAAGCUUGUUUGUUAGUGUGGCAACAUGCUGAUAGACUUGCGAACGAUGAAUUUGCAAGGUAGGUUUCGGCCGUCUUUAUACAAUUAACGAUCAACUCAGAACUGAAGCGGACAAAGGUAAUCCGACUGUUUAAUAAAAACAAAGCAUUGUGACGGCCUCAACAGGUGAUGACACAAUGUGAUUUCUGCCCAGUGCUCUGAAUGUCAAAGUGACGCAAUUCAACCAAGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACGCGCAUGAAUGGAUUAAUGAGAUUACCACUGUCCCUAUCUACUAUCUAGCGAACCCACAGCUAAGGGAACGGGCUUAGAAUAAUCAGCGGGGAAAGAAGACCCUGUUGAGCUUGACUCUAGUCUAACUUUGUGAAAUGGCACGUGGGGUAUAGCCUAGGUGGGAGAGCAAUCGAUCCUGUAAAACCACUACCCACGUAGUCAUUUUGCUUAUUUCGUGAAGAAAAGACUGGUGCAAACCAGUUCUAAAGUUAAGGUCAUUUAUUGACUGAUUUUUGCGAAAGACAUGGUUAGGGGGGGAGUUUGUCUGGGGCGGAAUGCCUGUUAAACCAUAACGCAGGCGUCCUAAGUGUAGCUCAGUGAGAACGGAAAUCUCACGUAGAACAAAAGGGUAAAAGCUACAUUGAUUUUGAUUUUCAGUAGGAAUACAAACCGCGAAAGCGUGGCCUAUCGAUCCUUUAACUUUACAAGUUUUAAGCUAGAGGUGUCAGAAAAGUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCAGCCAAGAGUUCAUAUCGACGUUGCUUUUUGAUCCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUAUCAUUGUGAAGCAGAAUUCACAACGUGUCGGAUUGUUCACCCGCUAAUAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUAGUUUUACCCUACUGAUGAAACGAUGUUGCGACAGUAAUUUAAGUUAGUACGAGAGGAACACUUAAAUCAGAUAAUUGGUAAAUACGGUUGUCUGAAAAGACAAUGCCGUGAAGCUACCAUCUGUUGGAUUAUGACUGAAGGCCUCUAAGUCAGAAUCCAUGCUGGAAAGCAAUGUCUAAGUGUGAUGAUAAACGAAAAAAAAUAAAAAUUAAGUUCGAAAGGUAGAGCGGGGAAGAGCGAAAAAGCUUGACCUUAACUGCUAAUCGUAAUUCCAAAUUAUCAUCUACGUAAAUCUUUUGUAGACGACUUAACAUGGAACGGGUAUUGUAAGCAUGAGAGUAGAAUUUCCUACGAUCUGCUGAGAUUCAGCCCGUCUCCUUAGAUUUAUCU
........................(((((......(...[..).......)))).).........((....))...((((......((.]...)).....))))...((((.........(((((..(((.....)))..))))....)........(((((..(((...(((..(((((((((....({((((......)))))[[(...).(((....}]]))).......)))))))..)).)))...)))..)))).)...)....(((((((........))))))).....(((((..[[[[[[)))))..)))..................................((....))............(..((((....))))..........).....................(.(((((((.....(...((((.(((((.....(((....(((((.((..((.(...((((((.(......)))))))..)..))...)))))))....)))....))))).))))..((((((((.(((((((.((((((......(((..((((..(((....))).))))...)))....)))))).))))))).....(((....))).))))))))...)...))))))).).[((((........))))((((((....(((.(((((((((..(((...(((........)))...)))...((....))........(((((...(((....)))....))))).(((((((....(((...)))....)).))).))....))))))))).)))..((.(...((((((.....((((((((((.(((....(((((((....)))))))....[)))...(((..((.((........)))).)))..).))))))))).(.((.......))...)..))))))......).))..((((((....(.(((....))).)(((((((((.....(((.(((((((((...(((....(((....(((..(((((((((...))))))))))))....)))..)).)...)))))))...(((.((((((..(......))))))))))....)))))..))))))).))..((((.(((((.....))))).))))....(((......)))...((((((....((([[[...(.((((((......(..........(((.((((((((((.......(((((------------------------------------------------)))))...)))))))))))))..........]]].)....))))))))))....))))))(((((((((.........)))))))))....))))))(.((((((((((......((((.((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.....((((((.......))))))((((.....((((..((..(((((((...((.....)).)))))).....[(((.((...(((..(((......)))......(...(((((......))))).).)))....))...(((((........)))))].((((.((((..((...(((....))).....<.((((((...((((.((((((((((((((((((...{{..))))))(...(((((...((((((.....(((.....))).....)).))))....)))))....)(((((((.------))))))))))).).))))))).))))(...)....)))))).........))..)))))))).))).))).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((.....(((((((.((..(....(.......(((((....(.{..).....)))))((.((((((...--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------)))))).))(...).......(((((((((.].((.........))...(((((((....((((....))))......))))))).}.(((.(((..((((((.(...((.....(((......))).....)).)))))..)))))((((((.......))))))........((..........(((((.......)))))..)..)....)))....)).))))))).)..))).)))))))..))))))....)).{..(((((.....]}.)))))....(((((..(((.((......((((.((((((..(((((..(((((((..((((((((((.---------------------------------------------------------))))))))))...(((((.....((((..(((((....))))).........>..(((((.....)))))..))))..))))).....)))))))...)))))..(((......[)).)((((((..........]))))))([((...(((((((.(.((((((.......))))))...).((][.[[[))....)))))))...(((..((((....{..))))..))).(((....))).))]]].].....(((((.(.(((.]]]]]])))).)))))....)}....))))..)))))).......((.(.(.((((((...((.......))...))))))...)).).).........(((.((((((..(((((((((......))))))..))).(((.(.....).))).....)))))..)...))).......(((((((....))).))))....))..))).))))).....((((((((..((((.(((((((......(....).....)))))))(((((...((((....((((((((((}}..)))))..)))))...))))..))))).((((...((((.............))))...)))).))))....))))))))...(.((((((((....(.((................)))...(.((((...(((...((((......))))..)))...)))))..............)))))))))....((((((.(..(.......)..)....((((((((.(((....(((.((..((((......))))..)))))...)))....))))).)))...)))))).--