You are 4279272 visitor.
Currently 11 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
2Y0Y NA0993 A, V, W, X, Y, 11RIBOSOMEX-Ray Difraction3.12010-12-07


model 1
>strand_A
UUUGUuGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGGGGUUUUACUCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUCGGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAUCAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUGAGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCUUGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUACCGGGGUAAUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGGGCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCCGCGAGGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCCAGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGGCGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU
-----....((((..[.[[[..)))).((((.(((((..(((((((((....(((..((..(((..((.(((..(.............)..))).)))))......(((......((((((((..((...(((((((.((.......((...(....)...))........))....((((.((((......)))).))))...((((...)))).)))))))..))))))))))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).((.((............)).))...(.(...)).....)).))).).....(.(((...(((((....)))).))))).)).))))))...(((......((((....)))).....))).....(((((...(....((((.....)))).....)....)))))......((((([[[...(((((.....((.]]])).......))))))))))..)))))))))...........(([[...(.((((...(((.(((((((.((((((((((......((((.(.....).))))....))))))))..)))))))))..(((((((((...((((((((...(((((((....((........)).......)))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))......{...((((((..((((((((((...))))))))))...((..]])).....)))))))))..(((......((((....))))....)))...]]].](((((.(((((((.((..(((((..((((((((((......((........))..........(((((((..(...(((.........(((((....)))))........................)))).((.(((...((((((.(....(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((.(((((((...(..............).....)))))))..(..(((((....))))).....)..)))).....).).)))...)).)))))....)))))))...)).)))))))).(...(((((((.....(((..((..((((....))))..))....))).....)))))))......(....((((((..........))))))....)..)..))))).....(((((((..........)))))))......))...)))))))))).))..(.(..((.(.((((.(((..(((((((((((((...(.((((....(((....))).)))).)..)))))))))))))..))).))))..).))...)..)..(((((((((....)))))))))}..-------------
>strand_V
gCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA
(((((((..((((........)))).(((((..[[[..))))).....(((((.......))))))))))))....
>strand_W
gCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA
....(....((((........)))).((((.........)))).......(((.......)))....)........
>strand_X
GGCAAGGAGGuAAAAAUGUUCUGAAAA
----------........]]][[....
>strand_Y
AGGGGCGuAGUUCAAuuGGuAGAACACCGGUcUCCAaAACCGGGUgUUGGGAGuuCGAGUCUCUCCGCCCCUGCCA
...((((...((..........)).((((((...]]..))))).)...(((((.......))))))))).......
>strand_1
gu
..