You are 4279264 visitor.
Currently 8 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
1YHQ RR0112 0, 91RIBOSOMEX-Ray Difraction2.42005-01-10


model 1
>strand_0
GUUGGCUACuAUGCCAGCUGGUGGAUUGCUCGGCUCAGGCGCUGAUGAAGGACGUGCCAAGCUGCGAUAAGCUGUGGGGAGCCGCACGGAGGCGAAGAACCACAGAUUUCCGAAUGAGAAUCUCUCUaACAAUUGCUUCGCGCAAUGAGGAACCCCGAGAACUGAAACAUCUCAGUAUCGGGAGGAACAGAAAACGCAACGUGAUGUCGUUAGUAACCGCGAGUGAACGCGAUACAGCCCAAACCGAAGCCCUCACGGGCAAUGUGGUGUCAGGGCUACCUCUCAUCAGCCGACCGUCUUCACGAAGUCUCUUGGAAUAGAGCGUGAUACAGGGUGACAACCCCGUACUGAAGACCAGUACGCUGUGCGGUAGUGCCAGAGUAGCGGGGGUUGGAUAUCCCUCGCGAAUAACGCAGGCAUCGACUGCGAAGGCUAAACACAACCUGAGACCGAUAGUGAACAAGUAGUGUGAACGAACGCUGCAAAGUACCCUCAGAAGGGAGGCGAAAUAGAGCAUGAAAUCAGUUGGCGAUCGAGCGACAGGGCAUACAAGGUCCCUUGACGAAUGACCGAGACGCGAGUCUCCAGUAAGACUCACGGGAAGCCGAUGUUCUGUCGUACGUUUUGaAAAACGAGCCAGGGAGUGUGUCUGUAUGGCAAGUCUAACCGGAGUAUCCGGGGAGGCACAGGGAAACCGACAUGGCCGCAGGGCUUUgCCCGAGGGCCGCCGUCUUCAAGGGCGGGGAGCCAUGUGGACACGACCCGAAUCCGGACGAUCUACGCAUGGACAAGAUGAAGCGUGCCGAAAGGCACGUGGAAGUCUGUUAGAGUUGGUGUCCUACAAUACCCUCUCGUGAUCUAUGUGUAGGGGUGAAAGGCCCAUCGAGUCCGGCAACAGCUGGUUCCAAUCGAAACAUGUCGAAGCAUGACCUCCGCCGAGGUAGUCUGUGAGGUAGAGCGACCGAUUGGUGUGUCCGCCUCCGAGAGGAGUCGGCACAcCUGUCAAACUCCAAACUUACAGACGCUGUUUGACGCGGGGAUUCCGGUGCGCGGGGUAAGCCUGUGUACCAGGAGGGGAACAACCCAGAGAUAGGUUAAGGUCCCCAAGUGUGGAUUAAGUGUAAUCCUCUGAAGGUGGUCUCGAGCCCUAGACAGCCGGGAGGUGAGCUUAGAAGCAGCUACCCUCUAAGAAAAGCGUAACAGCUUACCGGCCGAGGUUUGAGGCGCCCAAAAUGAUCGGGACUCAAAUCCACCACCGAGACCUGUCCGUACCACUCAUACUGGUAAUCGAGUAGAUUGGCGCUCUAAUUGGAUGGAAGCAGGGGCGAGAGCUCCUGUGGACCGAUUAGUGACGAAAAUCCUGGCCAUAGUAGCAGCGAUAGUCGGGUGAGAACCCCGACGGCCUAAUGGAUAAGGGUUCCUCAGCACUGCUGAUCAGCUGAGGGUUAGCCGGUCCUAAGUCUCACCGCAACUCGACUGAGACGAAAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUGCCAUCAUGCAGUGAAAGUUGACGCCCUGGGGUCGAUCACGCCGGGCAUuCGCCCGGUCGAACCGUCCAACUCCGUGGAAGCCGUAAUGGCAGGAAGCGGACGAACGGCGGCAUAGGGAAACGUGAUUCAACCUGGGGCCCAUGAAAAGACGAGCAUGAUGUCCGUACCGAGAACCGACACAGGUGUCCAUGGCGGCGAAAGCCAAGGCCUGUCGGGAGCAACCAACGUUAGGGAAUUCGGCAAGUUAGUCCCGUACCUUCGGAAGAAGGGAUGCCUGCUCCGGAACGGAGCAGGUCGCAGUGACUCGGAAGCUCGGACUGUCUAGUAACAACAUAGGUGACCGCAAAUCCGCAAGGACUCGUACGGUCACUGAAUCCUGCCCAGUGCAGGUAUCUGAACACCUCGUACAAGAGGACGAAGGACCUGUCAACGGCGGGGGUAACUAUGACCCuCUUAAGGUAGCGUAGUACCUUGCCGCAUCAGUAGCGGCUUGCAUGAAUGGAUUAACCAGAGCUUCACUGUCCCAACGUUGGGCCCGGUGAACUGUACAUUCCAGUGCGGAGUCUGGAGACACCCAGGGGGAAGCAAAGACCCUAUGGAGCUUUACUGCAGGCUGUCGCUGAGACGUGGUCGCCGAUGUGCAGCAUAGGUAGGAGUCGUUACAGAGGUACCCGCGCUAGCGGGCCACCCAGACAACAGUGAAAUACUACCCGUCGGUGACUGCgACUCUCACUCCGGGAGGAGGACACCGAUAGCCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUACGCGCUCGAAAAGAUAUCGAGCGCGCCCUAUGGUCAUCUCAGCCGGGACAGAgACCCGGCGAAGAGUGCAAGAGCAAAAGAUGACUUGACAGUGUUCUUCCCAACGAGGAACGCUGACGCGAAAGCGUGGUCUAGCGAACCAAUUAGCCUGCUUGAUGCGGGCAAUUGAUGACAGAAAAGCUACCCUAGGGAUAACAGAGUCGUCACUCGCAAGAGCACAUAUCGACCGAGUGGCUUGCUACCUCGAUGUCGGUUCCCUCCAUCCUGCCCGUGCAGAAGCGGGCAAGGGUGAGGUugUUCGCCUAUUAAAGGAGGUCGUGAGCUGGGuUuAGACCGUCGUGAGACAGGUCGGCUGCUAUCUACUGGGUGUGUAAUgGUGUCUGACAAGAACGACCGUAUAGUACGAGAGGAACUACGGUUGGUGGCCACUGGUGUACCGGUUGUUCGAGAGAGCACGUGCCGGGUAGCCACGCCACACGGGGUAAGAGCUGAACGCAUCUAAGCUCGAAACCCACUUGGAAAAGAGACACCGCCGAGGUCCCGCGUACAAGACGCGGUCGAUAGACUCGGGGUGUGCGCGUCGAGGUAACGAGACGUUAAGCCCACGAGCACUAACAGACCAAAGCCAUCA
---------...(((((((((.....(((..((((((((.(((......((((((.[[..[[.))).....((((((...(((]]..]].)))......))))))...)))....(((...)))(--.)..(((((.....))))).))...((((((.....(...[..)......))))).).........((.....))...(((((.....((.]...))....)))))...((((...((..((((......)))....))).....((((((((......((((.....(((((((....({((((......)))))[[(...).(((....}]])))....)))))))......))))...)))))).)).)....(((((((........)))))))......(((((.[[[[[[)))))..)))......)..)))))).))...............((....))....))......(...(((.....))).............)).....)))))))))......(.((((((((((....((((((.(((....(....(((((....))))).....)...))).))))..)).)))))))))).<.(((........))).((((((....(((((((((((((..(((...((((.....))))...)))...((....))..(..((((...((((..-))))...)))))((((((....))))))...)))))))))))))..((.(...((((((.....((((((((((.((((...(((((((....)))))))...).)))....(((..((.((........)))).)))..).))))))))).(.(((.....)))...)..))))))......).))..((((((....(((((....)))))..((((((...(((.(((((((((...(((.....((..((.----------------------------))..))...)).)...)))))))))))).......)))))).....((((((((((.....))))))))))....(((......)))...(((((((...((([[[...(.((((((.....((...........(((.((((((((((.......(((((.((...(((.........)))...))........(((......)))..)))))...)))))))))))))..........]]]))....))))))))))...)))))))(((((((.......)))))..))....))))))(.(.((((((((......((((((((....))))))))...)))))))).)..).....))))))((.....((.......((((((.......))))))((((....((((..((..(((((((...((.....)).))))))....[[(((.((...((((((.((.....))..)))))).....))...(((((........)))))]]((((((((.......(((...((((((((...((((((((((((..-{{.))))))(...(((((....(((((....(((.....))).....))))).....)))))....)(....)))))))...))))))))(...)....)))..)))))))).))).))).....((......)).))))..(((.......)))..))))...((((.....((((((((.((..(....(.......(((((....(.[..).....)))))(((((((((.....)))))))))(...).......(((((((((...((.........))...(((((((.....(((....))).......))))))).].(((.(((..(((((((..(((.....((((......)))).....))))))))..)))))((...------------))........((..........(((((.......)))))..)..)....)))....)).))))))).)..))).)))))))).))))))....)))[[..(((((.....>]])))))..(((((((..(((.((......((((.((((((..(((((.((((((((..(((----------------------------------------------------------------------------------------------------..)))...((((....)))).....))))))))..)))))..(((......[)).)((((((..........]))))))([((...(((((((.(.((((((-----..))))))...).((][.[[[))....)))))))...(((((((((.........))))))))).(((....))).))]]].].....(((((.(((((.]]]]]]))))))))))....).....))))..)))))).......((((.(.((((((...((.......))...))))))...)))).).......(((((.((((((..(((((((((......))))))..)))..((((.....))))......)))))..)...))).))....(((((((....))).))))....))..))).)))))))....--((((((...((((..((((((((.....(....)....))))))))(((((...((((...((((((((((}}..)))))...))))).[.)))).)))))..(((....((((.............))))....))).)))).......)))))).....(((((((((.......)))))....(((.((((((((....(((((..(....)..)))))...))))]))))..)))...))))..--------
>strand_9
uUAGGCGGCCACAGCGGUGGGGUUGCCUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCCACCAGCGUUCCAGGGAGUACUGGAGUGCGCGAGCCUCUGGGAAAUCCGGUUCGCCGCCACC
...((((((....((((((((......((((((...(.....)...))))..))....)))))).))...((.((.....((((((.((....))))))))....)).))...))))))...